# 结构粗优化

# 概述

分子结构粗优化模块是一款基础工具，可将输入的二维或三维分子结构（如.mol文件或SMILES字符串），通过ETKDGv2算法和MMFF力场进行快速三维构象生成与能量优化，最终输出能量更低、更稳定的三维分子结构文件（.sdf等），为后续计算提供可靠的初始结构。

# 使用步骤

输入小分子文件

支持多种格式，例如mole.smi

SMILES Name
Cc1nc(CNC(=0)[C@H]2CCC[N@H+](c(C)C)C2)cc(=0)[nH]1 ZINC00095501764
0=C(CN1CCSC1=0)N[CH]1CC[N@H+]2CCCC[CH]12 ZINC225173292
C[N@@H+](CC(=0)NC(N)=0)[C@H]1CCCN(c2ccccc2)C1 ZINC081013941
0=C(Cn1cnnn1)N1CC@H]2CC[CH](C1)[N@H+1(CC1CC1)C2 ZINC0095498324
CC[N@H+]1ccc[c@@H]1CNC(=0)C(=0)NCC(C)C ZINCe4689046
0=C(CN1CCSC1=0)N[C@aH]1CC[N@H+]2CCCC[CaH]12 ZINC225173254
CN1CCo[C@@H](C(=0)N2CCCINH+13CCC[C@H3C2)C1 ZINC00081306136
CC[N@H+]1CCC[C@H]1CNC(=0)C(=0)NCC(C)C ZINC468947

输入生成文件名称

输入生成的文件名称和目标文件格式类型。

查看结果

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